История города начинается с возведения Батуринской крепости в начале XVII века. В долине реки Сейм Батуринска цитадель была последним опорным пунктом и наиболее укрепленной частью крепости. С 1669 цитадель батуринской крепости была представительством великих вождей украинской нации – Демьяна Многогрешного, Ивана Самойловича, Ивана Мазепы и Кирилла Разумовского. Сейчас Цитадель Батуринской крепости – это культурная композиция, которая входит в состав Национального историко-культурного музея-заповедника «Гетманская столица».