Історія міста розпочинається зі зведення Батуринської фортеці на початку XVII століття. У долині річки Сейм Батуринська цитадель була останнім опорним пунктом і найбільш укріпленою частиною фортеці. З 1669 року цитадель батуринської фортеці була представництвом великих вождів української нації – Демяна Многогрішного, Івана Самойловича, Івана Мазепи та Кирила Розумовського. Нині Цитадель Батуринської фортеці – це культурна композиція, яка входить до складу Національного історико-культурного музею-заповідника «Гетьманська столиця».